工程居间合同的收费标准通常在合同总金额的1%到5%之间，但具体点数会根据多种因素有所调整，包括工程类型、利润大小、付款条件等。同时，税务合规也是必须考虑的重要因素，因为如果居间费超过了合同确认收入金额的5%，超出部分可能无法作为合法的税前扣除。
此外，也有案例显示，工程居间费有时会约定为合同金额的4.5%，或者根据工程进度比例分次支付，总费用在3%到5%之间。
综上所述，工程居间费的收取应合理、公正，并充分考虑行业特点和服务内容。建议在签订合同时，双方充分协商并明确约定居间费的标准和支付方式，以确保合法合规并减少潜在的纠纷。