三沙市的驻军包括以下几部分：
中国人民解放军海南省三沙警备区
隶属海南省军区，为正师级单位。
接受海南省军区和中共三沙市委员会、三沙市人民政府的双重领导。
下辖4个基层人民武装部：
三沙市永兴（镇）人民武装部，驻永兴岛，辖区范围为永兴岛、石岛。
三沙市七连屿人民武装部，驻赵述岛，辖区范围为七连屿。
三沙市永乐群岛人民武装部，驻晋卿岛，辖区范围为永乐群岛。
三沙市南沙人民武装部，驻永暑岛，辖区范围为南沙群岛。
海军西沙水警区
隶属中国人民解放军海军南海舰队榆林基地，为正师级单位。
主要担负有关管辖海域的防卫作战任务。
辖内有解放军全军唯一的西沙雨水班。
海军南沙巡防区
隶属中国人民解放军海军南海舰队榆林基地，为正团级单位。
主要担负有关管辖海域的防卫作战任务。
以定期轮换方式驻守。
武警现役部队
中国人民武装警察部队三沙市边防支队，与三沙市公安边防支队“一个机构、两块牌子”，是中国最南端的公安执法队伍。
设有永兴边防派出所和永乐群岛、七连屿2个警务工作站。
中国人民武装警察部队三沙市消防支队，与三沙市公安消防支队“一个机构、两块牌子”，人员编制60人。
台湾“海岸巡防署”南沙指挥部
在太平岛设立了南沙指挥部，总兵力约110人。
其他势力
菲律宾在所占岛礁上进驻了1000名左右的海军陆战队士兵。
马来西亚在弹丸礁拥有一条600米长的简易飞机跑道。
综上所述，三沙市的驻军包括中国人民解放军海南省三沙警备区及其下属的四个基层人民武装部、海军西沙水警区、海军南沙巡防区、武警三沙市边防支队、武警三沙市消防支队，以及台湾“海岸巡防署”南沙指挥部。此外，菲律宾和马来西亚也在三沙市周边岛礁上驻有军事力量。