办理房产查封的部门主要包括以下几类：
人民法院：
人民法院是主要的查封房产的机构，可以依照生效法律文书要求办理查封登记。
国土房产部门：
国土房产部门负责根据法院提交的资料进行查封处理，具体包括向法院发出协助执行通知书及相关法律文书，办案人员出示法院工作证等步骤。
房产交易中心：
在特定情况下，如交易纠纷，房产交易中心也可以进行查封，冻结房产证。
监察委员会：
监察委员会等有权机关对不动产依法实施查封等措施，需依照生效法律文书要求办理查封登记。
人民检察院：
人民检察院同样有权对不动产实施查封等措施，也必须遵循生效法律文书的要求。
公安机关：
在某些情况下，公安机关也可以参与查封房产的过程。
综上所述，办理房产查封的主要部门是人民法院，但国土房产部门、房产交易中心、监察委员会和人民检察院等有权机关在一定条件下也可以办理查封登记。建议在进行房产查封时，相关当事人应咨询专业律师并严格按照法律规定和程序办理。