果树损伤的赔偿应遵循以下步骤和原则：
确定赔偿标准
赔偿标准应根据果树的种类、树龄、生长情况以及当地的相关政策来确定。不同种类的果树在不同生长阶段的赔偿标准不同，例如苹果树、梨树、桃树、杏树等都有各自的赔偿标准。
计算实际损失
赔偿金额应包括直接损失和间接损失。直接损失是指果树的实际价值，可以根据当地市场行情和相同年龄的同类树种价格来计算。间接损失是指预期利益损失，可以根据上一年的收入计算，再乘以相应的年限。
参考市场价格
在确定赔偿金额时，可以参考当地政府部门出台的青苗补偿标准，结合种植的间距计算出单棵果树的补偿金额，并在此基础上进行上下一定比例的浮动来商讨赔偿标准。
考虑可得利益
如果因果树损伤导致未来产量减少，这部分损失也应计入赔偿金额中。例如，如果补种的果树无法在来年有效挂果，那么减产的部分即为可得利益损失。
协商赔偿金额
赔偿金额应通过双方协商确定。如果双方无法达成一致，可以寻求法律援助或提起诉讼。
遵循法律规定
赔偿应遵循《中华人民共和国土地管理法》和《民法典》等相关法律法规，确保赔偿的公平性和合理性。
示例
假设一株苹果树在盛果期（9-25年）的平均每株补偿标准为600-1800元，若该树因损伤需要赔偿，则赔偿金额应按此标准计算。若损伤导致果树无法继续生长，还需考虑预期利益损失，例如该树未来几年的产量损失。
建议
及时沟通：尽快与相关部门或责任人进行沟通，明确赔偿标准和计算方法。
收集证据：保留好果树损伤的照片、相关技术文档和市场价格信息，以便在协商或诉讼中使用。
寻求专业帮助：如果赔偿问题复杂，可以咨询专业律师或法律顾问，以确保自身权益得到充分保障。